물 자연 그리고 사람 - 물로 더 행복한 세상을 만들어가겠습니다.
HOMER&D성과논문실적

논문실적

Full Sequence Analysis and Characterization of a Human Astrovirus Type 1 Isolate from South Korea 게시글의 제목, 학술지명, 저자, 발행일, 작성내용을 보여줌
Full Sequence Analysis and Characterization of a Human Astrovirus Type 1 Isolate from South Korea
학술지명 Journal of Microbiology 저자 이규철,이성근,강래형,정원화,오미화,박수정,백순영
발표일 2013-02-01

Human astroviruses are recognized as an important cause ofinfantile gastroenteritis around the world. In South Korea,sporadic cases of HAstV infection have been reported since2002. However, hitherto, there have been no studies reportingthe whole genome sequence of an HAstV isolate fromSouth Korea. Hence, we sequenced and analyzed the entiregenome of an HAstV-1 strain (lhar) that was isolated inSeoul, South Korea. The whole-genome sequence analysisrevealed 3 open reading frames comprising the whole genome:ORF1a (2,763 bp), ORF1b (1,548 bp), and ORF2(2,364 bp). The lhar strain showed amino acid identitieswith 8 other reference strains of 87.6?98.7%, 94.2?98.8%,and 62.6?99.0% in the ORF1a, ORF1b, and ORF2 regions,respectively. The amino acid sequence of the capsid regionencoded by ORF2 was compared with a total of 19 HAstV-1strains and 8 HAstVs reference strains isolated in variouscountries. This revealed 1 amino acid substitution, at aa412(Pro → Arg) in ORF2. This study, the first to report the fulllengthsequence of an HAstV isolated in South Korea, ismeaningful in that it can be used as a full-length HAstV sequencestandard for future comparison studies. It may alsoprove useful to the field of public health field by facilitatingthe diagnosis and the prediction of new emerging variants.

목록