The control point management system based upon GIS is required to manage bench marks. The function of control pointmanagement system was developed to establish the prototype of integrated water management. GIS tools, which havebeen operated in K-water, are considered to interwork between thematic maps and control points. GIS tools areprogramed with ArcObject component in dot NET environment. This system provides the search, add, edit, view and printfunctions as shown in figure 1~3.New bench marks from spirit leveling and the control point management system based on GIS play an important role inthe installation of facilities and the operation and management of the experimental catchment. It is expected to greatlycontribute to build reliable hydrological data for future systematic experimental catchment management.