In this study, the complete mitochondrial genome sequences of Iksookimia hugowolfeldi, Korean loachspecies, was determined using next-generation sequencing analysis. The complete mitogenome of I.hugowolfeldi has 16,634 bp in length and consists of 13 protein-coding genes (PCGs), 22 tRNAs, tworRNAs, and one control region (D-loop). Both gene orders and characteristics were exactly accord withmitochondrial genome of other species those belong to the family Cobitidae. Phylogenetic analysisrevealed that the establishment of taxonomic relationship between Iksookimia and Cobitis has stilluncompleted because of the not distinguished as monophyletic status.