Microcystin-LR, known for its highest toxicity, has been managed as the primary target for monitoring by WHO, most countries and the Korean Ministry of Environment in drinking water. With the expansion of microcystins management by WHO (2022) and USEPA (2016), Korea is also transitioning towards managing microcystins in drinking water. Consequently, it is crucial to reassess and reevaluate the appropriateness of the current analytical methods and their applicability in water qaulity monitoring. Currently, microcystin analytical methods primarily involve individual variant analysis through LC-MS/MS and immunoassay assisted quantification using ELISA with adda functional group as a common target site. 
The selection of quantitative analytical methods involves combinations that consider various factors such as the characteristics of the target material, availability of standard substances, pretreatment requirements, instrumental considerations, and cost factors, in addition to technical aspects. While EU adopts the LC-MS/MS method in compliance with ISO standards, the United States is the only country reported to utilize ELISA analysis with LC-MS/MS. This presentation highlights the current microcystin analytical methods, the development and utilization of total quantitative methods not limited by reference materials in LC-MS/MS. The necessary conditions for establishing a correlationship between LC-MS/MS results and ELISA results.